Das angrenzende Wattenmeer wird nicht ohne Grund als Kinderstube der Nordsee bezeichnet. Viele Fische verbringen hier ihre ersten Jahre, bevor sie dann ins offene Meer ziehen. Das Watt selbst birgt eine unerwartet reichhaltige Tierwelt. So sind die Schleifspuren und die vielen winzigen Poren im Sand keineswegs zufällig entstanden, sondern werden unter anderem von der wenige Millimeter großen Wattschnecke zwischen zwei Fluten geschaffen. Ebenso besiedeln die Schlickkrebse (bis zu 15 Millimeter groß) zu Millionen diese Zone vor dem Strand und bieten damit wiederum den zahlreichen Fischen und Vögeln reichlich Nahrung – unerlässlich für die außergewöhnliche Vielfalt und den Reichtum der Fisch- und Vogelarten im Watt.

Miesmuscheln – stellenweise bis zu mehreren Tausend pro Quadratmeter, zu regelrechten Kolonien verbunden nur durch Sekretfäden finden sich im sauerstoffreichen Sandwatt. 
Pazifische Auster - Nachdem die Europäische Auster im Wattenmeer durch Überfischung und/oder Erkrankung weitgehend verschwunden war, wurde seit 1913 versucht, exotische Austernarten zu kultivieren. So ist die seit den 70er Jahren vermarktete „Sylter Royal“ keine andere als die Pazifische Auster. Die Annahme, dass diese asiatische Art sich hier nicht natürlich vermehren könne, war falsch. Mittlerweile besiedelt sie in großer Zahl das Watt und insbesondere die Miesmuschelbänke. Die Miesmuschelfischer befürchten, dass die Pazifische Auster die Miesmuschel verdrängen oder zumindest die Miesmuschelkultur empfindlich stören könnte.

Spiekeroog ist, im eigentlichen Sinne, also nicht nur eine Insel für menschliche Touristen. Den wesentlich größeren Teil machen die vielen gefiederten Besucher aus, die folgerichtig auch mehr als die Hälfte der Insel in Anspruch nehmen.
Die langen Sandstrände, die Primärdünen und vor allem das Wester- und Ostergroen sowie die Ostplate bieten den sesshaften wie auch vorbeiziehenden Vögeln Brut- und Futterplatz. Besonders attraktiv an dieser Insel ist für die Vögel, wie auch für Menschen, die Ruhe und Weitläufigkeit – aber eben auch das außergewöhnliche Nahrungsangebot in Küstennähe, im Wattenmeer und den Salzwiesen.
Millionen von Zugvögeln versorgen sich jährlich bei ihrem Aufenthalt im Wattenmeer mit den nötigen Fettreserven, die sie für den Rückflug in ihre Brutgebiete brauchen – ganz zu schweigen von den vielen Millionen hier ansässigen Watvögeln, Gänsen, Enten und Möwen. Spiekeroog selbst bietet mit der Ostplate und den weiten Sandstränden und Primärdünenanlagen ein für die Vogelwelt wichtiges Rückzugs- und Brutareal.

Neben diesen, meist auch im Binnenland gut bekannten Vögeln, gibt es einige weitere Vogelarten, die sich auf das Leben im Watt spezialisiert haben. Dazu gehört zum Beispiel der Säbelschnäbler – leicht zu erkennen am melodischen Ruf und dem nach oben gebogenen Schnabel. Der Austernfischer, der gerne auch Halligstorch genannt wird hat eine ganz besonder Schnabelform. Mit nach unten gebogenen Schnäbeln „pflügen“ die Brachvögel durch das Watt, während die wenig flugbegabten Rallen, vor allem Blesshühner, ebenfalls hier anzutreffen sind. Wesentlich seltener dagegen finden sich vom Aussterben bedrohte Vögel, wie die Zwergseeschwalbe.